Ute Müller hat in den 1980er Jahren in Berlin an der TU den Ingenieur-Studiengang ‚Technischer Umweltschutz‘ mit der Vertiefung Abfallwirtschaft abgeschlossen. Schon nach wenigen Jahren in der klassischen abfallwirtschaftlichen Planung und Beratung bei der ITU Ingenieurgemeinschaft Technischer Umweltschutz hat sie ihren Fokus auf die Datenverarbeitung (z. B. Abfallmengenprognosen, Geruchsausbreitungsrechnungen) und den Einsatz von IT-Systemen (z. B. Steuerung von Kompostwerken, Digitalisierung der Abfallbewirtschaftung) gelegt.

1995 hat Ute Müller zusammen mit Kolleg*inn:en die ITU system Umweltdatenmanagement GmbH aus der EDV-Abteilung der ITU Ingenieurgemeinschaft heraus gegründet und ist seitdem Geschäftsführerin. Im Jahr 2024 wurde Governikus die neue Gesellschafterin der Governikus ITU GmbH.

Neben der Tätigkeit als Geschäftsführerin berät und unterstützt sie Kunden in Fragen des Abfallrechts, insbesondere an der Schnittstelle zur IT-technischen Umsetzung. Ute Müller ist Expertin für das elektronische Abfallnachweisverfahren und andere Themen der Digitalisierung in der Abfallwirtschaft, wie der internationalen Abfallverbringung.